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Groupes Fonctionnels (pour l'ARN)

 
Functional Groups
Position
 
5’
3’
int
Amino
X
X
X
Phosphate
X
X
 
Phosphorothioate (PTO)
 
 
X
 

Amino

 

Un groupe amino primaire peut être utilisé pour fixer une variété de modificateurs (tels que des dyes fluorescents) à un oligonucléotide ou utilisé pour fixer un oligonucléotide à une surface solide. Les modificateurs aminés peuvent être positionnés à l'extrémité 5' avec un bras spacer (C6) ou plus long (C12). Les modifications aminées peuvent être positionnées à l'extrémité 3'. Les modifications aminées internes peuvent être introduites en utilisant une base amino-dT.

 
Functional Group
Position
Synthesis Scale [µmol]
Purification
 
 
0.04
0.2
1.0
15
Des
HPLC
PAGE
Amino C6
5’
X X X X X X X
3’
X X X X X X X
X = available/on stock
O = on request
 

Phosphate

Phosphate
 
 

La phosphorylation en 5' est nécessaire si un oligo est utilisé comme substrat pour l'ADN ligase. La phosphorylation 3' inhibe la dégradation par certaines 3'-exonucléases et peut être utilisée pour bloquer les polymérases de l'ADN.

 
Position
Synthesis Scale [µmol]
Purification
 
0.04
0.2
1.0
15
Des
HPLC
PAGE
5' X
X
X
X X
X
X
3' X
X
X
O X
X
X
X = available/on stock
O = on request
 

Phosphorothiate (PTO)

PTO
 
 

La liaison phosphorothioate (PTO) remplace un atome de soufre par un oxygène non pontant dans le squelette phosphate d'un oligo. Cette modification rend la liaison internucléotidique résistante à la dégradation par les nucléases. Des liaisons phosphorothioate peuvent être introduites entre les 3-5 derniers nucléotides à l'extrémité 5' ou 3' de l'oligo pour inhiber la dégradation par les exonucléases. L'inclusion de liaisons phosphorothioate dans l'ensemble de l'oligo contribuera également à réduire l'attaque des endonucléases.

 
Position
Synthesis Scale [µmol]
Purification
 
0.04
0.2
1.0
15
Des
HPLC
PAGE
Int X
X
X
X X
X
X
X = available/on stock
O = on request