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Quenchers (pour l'ADN)
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Type of Modification
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Position
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Quenching Range
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||
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5’
|
3’
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Int.
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(nm)
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X
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480-580 / 560-670 | |||
| Dabcyl |
X
|
400-550 | ||
| IQ-500 |
X
|
400-550 | ||
| MGB-Q500 | X |
|
400-550 | |
| MGB-Q530 | X |
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450-620 | |
Black Hole Quencher-1
Le BHQ-1 est mieux adapté aux fluorophores qui émettent dans la gamme de longueurs d'onde allant de FAM à TAMRA.
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Position
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Synthesis Scale
|
Purification
|
|||||
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|
0.04
|
0.2
|
1.0
|
15
|
Des
|
HPLC
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PAGE
|
|
5’
|
O | O |
O
|
|
|||
|
3’
|
|
X
|
X
|
O
|
|
X
|
|
X = available/on stock
O = on request
Black Hole Quencher-2
Le BHQ-2 est mieux adapté aux fluorophores dans la gamme de longueur d'onde Cy3 à Cy5.
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Position
|
Synthesis Scale
|
Purification
|
|||||
|
|
0.04
|
0.2
|
1.0
|
15
|
Des
|
HPLC
|
PAGE
|
|
5’
|
O | O |
O
|
|
|||
|
3’
|
|
X
|
X
|
O
|
|
X
|
|
X = available/on stock
O = on request
Dabcyl
Le Dabcyl est un dark quencher relativement faible et est mieux adapté à une utilisation pour les sondes molecular beacon où épingle à cheveux plaçant le quencher et le dye à proximité immédiate.
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Position
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Synthesis Scale
|
Purification
|
|||||
|
|
0.04
|
0.2
|
1.0
|
15
|
Des
|
HPLC
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PAGE
|
|
3’
|
|
X
|
X
|
O
|
|
X
|
X
|
X = available/on stock
O = on request
Internal Quencher IQ-500
IQ-500 (quencher interne 500) est une unité de fluorescence quencher en position interne dans un oligonucléotide. Il peut ainsi être positionné à une distance FRET optimale par rapport à un fluorophore. IQ-500 est principalement utilisé comme quencher interne de sondes qPCR double quencher.
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Position
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Synthesis Scale
|
Purification
|
|||||
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|
0.04
|
0.2
|
1.0
|
15
|
Des
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HPLC
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PAGE
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| Int |
|
X
|
X
|
O
|
|
X
|
|
X = available/on stock
O = on request
MGB-Q500
Le MGB-Q500 est une unité de fluorescence quencher fixée à un minor groove binding (MGB). Cette modification 3' permet de concevoir des sondes de qPCR plus courtes, mais très spécifiques. La combinaison optimale est avec FAM en 5'. Le MGB-Q500 est une alternative rentable au MGB-Q530.
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Position
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Synthesis Scale
|
Purification
|
|||||
|
|
0.04
|
0.2
|
1.0
|
15
|
Des
|
HPLC
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PAGE
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| 3' |
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X
|
X
|
O
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|
X | |
X = available/on stock
O = on request
MGB-Q530
Le MGB-Q530 est une unité de fluorescence quencher très efficace, fixée à un minor groove binding (MGB). Cette modification 3' permet de concevoir des sondes qPCR plus courtes, mais très spécifiques, avec un niveau de bruit de fond très faible. La combinaison optimale est avec les sondes 5' FAM/HEX/JOE/Yakima Yellow.
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Position
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Synthesis Scale
|
Purification
|
|||||
|
|
0.04
|
0.2
|
1.0
|
15
|
Des
|
HPLC
|
PAGE
|
| 3' |
|
X
|
X
|
O
|
|
X | |
X = available/on stock
O = on request