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Frequently Asked Questions - Next Generation Sequencing

Échantillons et Préparation de la Librairie

Effectuez-vous un contrôle de qualité avant la préparation de la librairie ?

Oui, nous effectuons un contrôle approfondi de la qualité de vos échantillons à réception. Néanmoins, assurez-vous de faire votre propre contrôle qualité avant d'expédier les échantillons afin d'éviter des retards ou d'autres écueils dans le traitement.

Combien de temps conservez-vous mes échantillons d'ADN/ARN et mes amorces personnalisées ?
  • Les échantillons sont conservés pendant 3 mois
  • Les amorces NGS personnalisées sont conservées pendant 2 ans
Quand devrais-je utiliser le séquençage nouvelle génération et quand devrais-je utiliser la technologie Sanger pour le séquençage des amplicons ?

Il est assez difficile de répondre à cette question par des généralités, mieux vaut nous contacter pour discuter de votre projet en détail.

Séquençage

Quel est l'impact de la profondeur de séquençage, de la longueur de reads et du nombre de réplicas sur mon projet ?

Pour faire simple :

  • La profondeur de séquençage signifie la sensibilité
  • La longueur de reads est signifie la spécificité
  • Le nombre de réplicas signifie la confiance

Bioinformatique

Combien de temps conservez-vous mes données ?

Les données sont conservées pendant 3 mois.

Analysez-vous les données NGS déjà existantes ?

Oui, consultez nos services et contactez nos spécialistes en bioinformatique.

Pourquoi ai-je besoin d'un génome de référence ?

Outre le reséquençage, de nombreuses applications telles que le séquençage du transcriptome reposent sur un génome de référence de haute qualité comme base pour l'analyse approfondie. La séquence de référence complète garantit où compter, tandis que l'annotation de référence complète garantit ce qu'il faut compter. Des annotations supplémentaires d'un génome de référence permettent une analyse supplémentaire plus approfondie comme l'analyse des voies biologiques, la détection de transcrits alternatifs, etc.

Que faire s'il n'y a pas de génome de référence ou seulement un projet d'assemblage du génome ?

Il y a toujours des travaux dans la communauté - veuillez consulter notre service "Reference Transcriptome Sequencing" et nous contacter pour plus de détails.