Back to top

Séquençage des Petits ARN et des microARN

Small and microRNA Sequencing
 
 
Utilisez un petit séquençage d'ARN pour :
  • Étudier l'influence de l'ARN non codant sur les schémas d'expression des gènes
  • Découvrez de nouveaux éléments et processus réglementaires
Séquençage des petits ARN est le compagnon du séquençage de l'ARN, de la recherche fondamentale aux nouvelles approches thérapeutiques.

Aperçu

Considérations avant de commencer un projet de séquençage de petits ARN :

  • Fraction petite de l'ARN, tailles attendues ?
  • Types d'échantillons (sérum, types de cellules, tissus) ?
  • Profondeur de séquençage (sensibilité) ?
  • Répliques (confiance) ?
  • Nouveaux types d'ARN et/ou petits types d'ARN connus ?
  • Organisme modèle ou aucune entrée dans la base de données disponible ?

Laissez-nous vous guider - de la conception à l'analyse

Example projects using small RNA Sequencing:

  • Posttranslatory regulation studies
  • Discovery of new regulatory elements
  • Conditional biomarker detection
  • Functional experiments to uncover gene regulation
  • Part of an omics charcterization
  • Drug discovery/ drug target screens/ novel therpeutics
  • Discovery of new non coding regulatory RNA
  • Tissue specific piRNA and miRNA effects

Applications liées au séquençage de petits ARN :

  • Séquençage de l'ARN

Déroulement

 
Le graphique ci-dessous illustre un déroulement typique d'un projet de petite taille ou de miRNA. Veuillez noter que nos processus hautement modulaires vous offrent diverses options d'entrée et de sortie. Si vous externalisez la totalité de votre projet d'ENG à Microsynth ou seulement une partie de celui-ci, c'est à vous de décider.
 
 
Pour plus d'informations et une description technique détaillée, veuillez télécharger notre note d'application "Small RNA Sequencing" (voir les téléchargements correspondants).

Résultats

Les résultats produits par notre module d'analyse aident à répondre à trois questions principales d'une expérience de séquençage des miRNA visant par exemple à trouver des biomarqueurs pour une maladie spécifique.

  1. Y a-t-il différents modèles d'expression des miRNA dans une expérience ? (voir figure 1)
  2. Lequel des miRNA exprimés pourrait être nouveau ? (voir tableau 1)
  3. Quels sont les motifs enrichis dans les données miRNA ? (voir figure 2)

Figure 1: Cette figure montre une analyse en composantes principales (ACP) basée sur les modèles d'expression normalisés des échantillons analysés et illustre leur similarité les uns par rapport aux autres. Elle permet ainsi de déterminer si les conditions utilisées dans l'expérience conduisent à des schémas d'expression différents des miRNA.

 
Table 1: Ce détail d'un tableau de résultats montre le nombre brut de miRNA séquencés et leur similarité avec les miRNA déjà connus. Toutes les séquences de miRNA non appariées et donc éventuellement nouvelles, ainsi que leurs fréquences, sont répertoriées pour d'éventuelles recherches complémentaires.

Figure 2: Les motifs enrichis sont détectés et visualisés avec des mesures de signification et des informations supplémentaires (non indiquées)

Délai d'exécution

  • Livraison des données dans les 25 jours ouvrables suivant la réception de l'échantillon (y compris la préparation de la bibliothèque et le séquençage)
  • 10 jours ouvrables supplémentaires pour l'analyse des données (bioinformatique)
  • Service express possible sur demande